花椰菜菌核病病原为核盘菌（学名：Sclerotinia scleroriorum (Lib.) de Bary），属子囊菌亚门、柔膜菌目、核盘菌属真菌。菌丝体白色，绵絮状，粗细不一，直径3-4微米，透明，有横隔，内有浓蜜的颗粒状物。子囊盘杯状，浅肉色至褐色，1个至4个从菌核上生出，子囊盘直径0.3-0.8厘米，柄褐色细长，微弯曲，长4厘米左右，由盘基部向下渐细。子囊棍棒状，无色，（108-135）微米×（9-10）微米，内含8个子囊孢子，子囊孢子单行排列，椭圆形，无色，12微米×4微米；小型分生孢子单胞，无色，3-4微米，密生于分生孢子梗上，形成84微米×77微米的孢子块。侧丝细长，线形，夹生在子囊之间。 [1] [2-3]

病菌喜温暖高湿的环境。适宜发病的温度范围0-30℃，最适发病环境，温度为20-25℃，相对湿度90%以上；最适感病生育期为成株期至开花座果期。发病潜育期5-8天。子囊孢子萌发的适宜温度5-10℃，菌核萌发适温15℃。该病原除为害花椰菜外，还危害辣椒、茄子、番茄、豇豆、蚕豆、豌豆、马铃薯、胡萝卜、菠菜、芹菜、甘蓝等多种蔬菜。 [1] [4]

花椰菜菌核病在花椰菜花期为害最重，主要以茎基部、花球受害。当植株茎基部受害时，病部的边缘先呈不明显的水渍状不规则红褐色病斑，然后发生软腐，生成白色或灰白色棉絮状菌丝体，至茎基部病斑环茎一周后全株死亡。在病茎皮层腐烂、干枯后茎内可看到长出的白色菌丝并夹杂着鼠粪状黑色菌核。花球受害时，球基部呈现黑褐色条状或不规则病斑，随着病情的加剧整个花球开始由下至上发黑，最后花球变为黑褐色，干枯死亡。留种株多在终花期发病，可引起茎部腐烂、中空，表生白色絮状菌丝及黑色菌核；花梗和种荚受害时，病部呈白色或湿腐状，内生黑色细小菌核。 [1]

病原菌以菌核在土壤、种子、病残体、堆肥中越冬，通过土壤、种子及气流传播。条件适宜时，越季后的菌核萌发并散发出子囊孢子，随气流、雨水和昆虫传播。子囊孢子接触到寄主，首先在生活力衰弱的叶片及花瓣上侵染，发病后病部菌丝扩展或接触健部使之发病。 [1]

花椰菜菌核病发生与前茬作物密切相关。前茬若为十字花科、大豆、向日葵等连续种植多年的地块或花椰菜长期连作，会造成菌核在土壤中逐年累积，在适宜的气候条件下，增加菌核病的发病几率。调查前茬种植大豆的花椰菜地，结果表明，菌核病发病率比正常轮作田高出20—40%。花椰菜重茬发生率为15.5%，而且随着重茬年数的增加发病率增加，重茬3年的发病率高达50%。不同轮作模式对病害的发生也有不同影响，调查结果表明，大豆—花椰菜连作地块的子囊盘数量明显高于水稻—花椰菜连作地，即水旱轮作可以有效控制病害。 [1]

病害的发生与当地的相对湿度有密切的关系。在温度15—25℃、相对湿度70%以上时易发病。温、湿度适宜且无雨时，病害只在个别地块或局部发生。连续降雨2—3天时大部分地块发病，病害开始流行。据此推断，病害的流行可能是降雨提高了当地的相对湿度，从而利于病原菌的繁殖及侵染造成的。 [1]

随着蔬菜产业结构的调整，蔬菜种植面积不断扩大，土壤中积聚了大量的病原菌，这是病害发生的重要因素之一；受土地面积、灌溉条件、交通限制以及在经济利益的驱使下，重茬地面积不断增加，这也为病原菌的累积和病害的发生提供了有利条件。 [1]

播种时种子带菌；播种地施用未腐熟的带菌有机肥，偏施氮肥；平畦撒播且不中耕松土，造成土壤透气性差等，这些不合理的栽培措施是造成病害发生和流行因素之一。 [1]